Acronimo laboratorio:
MicAppLab
Responsabile Scientifico:
Rete tematica:
Tipo di Laboratorio:
Descrizione e Finalità:
Il laboratorio di Microbiologia Applicata si occupa in primis della i) analisi e caratterizzazione di microbiomi provenienti da varie matrici, inclusi quelli connessi ai beni culturali e agli ambienti che li mantengono; ii) ricerca e caratterizzazione di batteriofagi contro patogeni batterici.
Strumentazioni, Tecnologie, Risorse basate sulla conoscenza:
Il laboratorio è equipaggiato con strumentazione di base utile per indagini microbiologiche (cappa BSL2, centrifughe, bagnetti ed incubatori termostatati, spettrofotometro, sonicatore, termociclatori, autoclavi, strumentazione per elettroforesi di acidi nucleici e proteine) ed ha instaurato collaborazioni per l’utilizzo di strumentazioni per la generazione di dati Next Generation Sequencing (NGS). Inoltre, ha libero accesso a infrastrutture informatiche esterne dedicate per l’analisi di dati NGS. Il personale ha una comprovata esperienza nelle analisi microbiologiche in generale e nello studio approfondito di specie batteriche e loro virus.
Collocazione:
Università di Roma “Tor Vergata” Dipartimento di Biologia Edificio So.Ge.Ne. via della Ricerca Scientifica snc Settore L, Piano 1, Stanza 002L 00133 Roma
Dipartimento / Istituto / Azienda / Struttura di appartenenza:
Università di Roma “Tor Vergata” Dipartimento di Biologia
Partecipanti ricercatori di ruolo interni:
Prof. Marco Maria D’Andrea
Dott. Gustavo di Lallo
Dott. Gustavo di Lallo
Settori ERC:
Laboratorio inserito in una infrastruttura di ricerca:
No
Laboratorio convenzionato con soggetti di ricerca esterni:
No
Eventuali partner industriali e settori operativi:
Il laboratorio ha collaborato e collabora attualmente con GSK Vaccines, Siena per la validazione e la messa a punto di modelli animali, convenzionali ed alternativi, utili per lo studio di strategie antimicrobiche
Partecipazione alle attività di progetti internazionali:
No
Partecipazione alle attività di progetti nazionali:
Progetto PRIN 2022 “Lipophagoids as innovative therapeutic tools of
precision medicine against multi-drug resistant bacteria” (Prot.
20224T3X8K). 28/09/2023 – 28/02/2026. Il progetto si è concentrato nello sviluppo e la validazione di un nuovo approccio per il trattamento di infezioni batteriche sostenute da germi multi antibiotico resistenti. In particolare, è stato sviluppato un sistema di delivery di antimicrobici incapsulati in liposomi e veicolati verso i batteri bersaglio sfruttando proteine di origine fagica.
precision medicine against multi-drug resistant bacteria” (Prot.
20224T3X8K). 28/09/2023 – 28/02/2026. Il progetto si è concentrato nello sviluppo e la validazione di un nuovo approccio per il trattamento di infezioni batteriche sostenute da germi multi antibiotico resistenti. In particolare, è stato sviluppato un sistema di delivery di antimicrobici incapsulati in liposomi e veicolati verso i batteri bersaglio sfruttando proteine di origine fagica.
Partecipazione alle attività di progetti regionali:
No
Laboratorio aperto a utenti esterni:
No
Tariffario:
No
Regolamento di accesso e utilizzo:
No
Elenco delle pubblicazioni:
Olimpieri, T., Poerio, N., Saliu, F., Lorè, N.I., Ciciriello, F., Ponsecchi, G., Alghisi, F., Cirillo, D.M., D'Andrea, M.M., Fraziano, M. (2026). "Phosphatidylserine liposomes for Mycobacterium abscessus infections management in people with cystic fibrosis non-eligible for CFTR modulators". Frontiers in Immunology, 17, art. no. 1681558. DOI: 10.3389/fimmu.2026.1681558.
Gardenghi, C., Alabiso, A., D'Andrea, M.M., Frasca, S., Guglielmotti, V., Mazzuca, C., Orazi, N., Ercolani, B., Paoloni, S., Rubechini, A., Migliore, L. (2026). "The Biodeterioration Process in Compositionum: Four Ancient Multi-Material Volumes Studied by Multidisciplinary Approach". Applied Sciences (Switzerland), 16 (2), art. no. 1091. DOI: 10.3390/app16021091.
Vastola, S., Tortoli, M., Torricelli, S., Brazzoli, M., D'Andrea, M.M., Chiarot, E. (2026). "Unraveling the mouse model of Staphylococcus aureus bacteremia and sepsis: a systematic approach to better characterize host/pathogen interactions". Microbiology Spectrum, 14 (3), pp. 1-14. DOI: 10.1128/spectrum.02642-25.
Olimpieri, T., Poerio, N., Saliu, F., Lorè, N.I., Ciciriello, F., Ponsecchi, G., D'Andrea, M.M., Alghisi, F., Cirillo, D.M., Fraziano, M. (2025). "Phosphatidylinositol 5-Phosphate-Loaded Apoptotic Body-Like Liposomes for Mycobacterium abscessus Infection Management in Patients With Cystic Fibrosis". Journal of Infectious Diseases, 232 (1), pp. e43-e47. DOI: 10.1093/infdis/jiaf124.
Ravenscroft, N., Nonne, F., Belciug, G.F., Zaro, M., Molfetta, M., Di Benedetto, R., Alfini, R., Mfana, S., Bellich, B., D'Andrea, M.M., Carducci, M., Rossi, O., Giannelli, C., Cescutti, P., Micoli, F. (2025). "Structural elucidation and serological studies of emerging Klebsiella pneumoniae capsular polysaccharides K102 and K112". Carbohydrate Polymers, 370, art. no. 124385. DOI: 10.1016/j.carbpol.2025.124385.
Frasca, S., Alabiso, A., Rotini, A., Manfra, L., Vasquez, M.I., Christoforou, E., Winters, G., Kaminer, M., D'Andrea, M.M., Migliore, L. (2025). "A Helping Hand: Fungi, as Well as Bacteria, Support Ecophysiological Descriptors to Depict the Posidonia oceanica Conservation Status". Water (Switzerland), 17 (8), art. no. 1151. DOI: 10.3390/w17081151.
Di Pilato, V., Pollini, S., Miriagou, V., Rossolini, G.M., D'Andrea, M.M. (2024). "Carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae: the role of plasmids in emergence, dissemination, and evolution of a major clinical challenge". Expert Review of Anti-Infective Therapy, 22 (1-3), pp. 25-43. DOI: 10.1080/14787210.2024.2305854.
Alabiso, A., Frasca, S., Bartolini, M., Congestri, R., D'Andrea, M.M., Buratti, G., Costa, F., Meraviglia, M., Nebuloni, A., Migliore, L. (2024). "Home Sweet Home: Setting the Best Thriving Conditions for the Ad Hoc Engineered Microbial Consortium in the Zero Mile System". Sustainability (Switzerland), 16 (6), art. no. 2227. DOI: 10.3390/su16062227.
Frasca, S., Alabiso, A., D'Andrea, M.M., Cattaneo, R., Migliore, L. (2024). "Diversity and Composition of Posidonia oceanica-Associated Bacterial and Fungal Communities: Effect of Boat-Induced Mechanical Stress in the Villefranche-sur-Mer Bay (France)". Diversity, 16 (10), art. no. 604. DOI: 10.3390/d16100604.
Frasca, S., Alabiso, A., D'Andrea, M.M., Migliore, L. (2024). "Uncovering the Fungal Community Composition of Alive and Dead Posidonia oceanica Matte". Microbial Ecology, 87 (1), art. no. 170. DOI: 10.1007/s00248-025-02492-6.
Olimpieri, T., Poerio, N., Ponsecchi, G., Di Lallo, G., D'Andrea, M.M., Fraziano, M. (2024). "Phosphatidylserine liposomes induce a phagosome acidification-dependent and ROS-mediated intracellular killing of Mycobacterium abscessus in human macrophages". Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 14, art. no. 1443719. DOI: 10.3389/fcimb.2024.1443719.
Ponsecchi, G., Olimpieri, T., Poerio, N., Antonelli, A., Coppi, M., Di Lallo, G., Gentile, M., Paccagnini, E., Lupetti, P., Lubello, C., Rossolini, G.M., Fraziano, M., D'Andrea, M.M. (2024). "Characterization of four novel bacteriophages targeting multi-drug resistant Klebsiella pneumoniae strains of sequence type 147 and 307". Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 14, art. no. 1473668. DOI: 10.3389/fcimb.2024.1473668.
Alabiso, A., Frasca, S., Cantelmo, V., D'Andrea, M.M., Braglia, R., Scuderi, F., Costa, F., Savio, S., Congestri, R., Migliore, L. (2023). "A dirty job: dishwasher wastewater reuse and upcycle through an ad hoc engineered microbial consortium". npj Clean Water, 6 (1), art. no. 66. DOI: 10.1038/s41545-023-00280-8.
Piccirilli, A., Antonelli, A., D'Andrea, M.M., Cherubini, S., Perilli, M., Rossolini, G.M. (2022). "Molecular and Kinetic Characterization of MOX-9, a Plasmid-Mediated Enzyme Representative of a Novel Sublineage of MOX-Type Class C β-Lactamases". Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 66 (9). DOI: 10.1128/aac.00595-22.
Poerio, N., Caccamo, N.R., La Manna, M.P., Olimpieri, T., De Angelis, L.H., D'Andrea, M.M., Dieli, F., Fraziano, M. (2022). "Phosphatidylserine Liposomes Reduce Inflammatory Response, Mycobacterial Viability, and HIV Replication in Coinfected Human Macrophages". Journal of Infectious Diseases, 225 (9), pp. 1675-1679. DOI: 10.1093/infdis/jiab602.
Poerio, N., Riva, C., Olimpieri, T., Rossi, M., Lorè, N.I., de Santis, F., de Angelis, L.H., Ciciriello, F., D'Andrea, M.M., Lucidi, V., Cirillo, D.M., Fraziano, M. (2022). "Combined Host- and Pathogen-Directed Therapy for the Control of Mycobacterium abscessus Infection". Microbiology Spectrum, 10 (1), art. no. e02546-21. DOI: 10.1128/spectrum.02546-21.
De Santis, F., Lopez, A.B., Virtuoso, S., Poerio, N., Saccomandi, P., Olimpieri, T., Duca, L., Henrici De Angelis, L., Aquilano, K., D'Andrea, M.M., Aquaro, S., Borsetti, A., Ceccherini-Silberstein, F., Fraziano, M. (2022). "Phosphatidylcholine Liposomes Down-Modulate CD4 Expression Reducing HIV Entry in Human Type-1 Macrophages". Frontiers in Immunology, 13, art. no. 830788. DOI: 10.3389/fimmu.2022.830788.
Poerio, N., Olimpieri, T., Henrici De Angelis, L., De Santis, F., Thaller, M.C., D'Andrea, M.M., Fraziano, M. (2022). "Fighting MDR-Klebsiella pneumoniae Infections by a Combined Host- and Pathogen-Directed Therapeutic Approach". Frontiers in Immunology, 13, art. no. 835417. DOI: 10.3389/fimmu.2022.835417.
De Angelis, L.H., Ponsecchi, G., Fraziano, M., D'Andrea, M.M. (2022). "Application of Bacteriophages for Human Health: An Old Approach against Contemporary 'Bad Bugs'". Microorganisms, 10 (3), art. no. 485. DOI: 10.3390/microorganisms10030485.
Gardenghi, C., Alabiso, A., D'Andrea, M.M., Frasca, S., Guglielmotti, V., Mazzuca, C., Orazi, N., Ercolani, B., Paoloni, S., Rubechini, A., Migliore, L. (2026). "The Biodeterioration Process in Compositionum: Four Ancient Multi-Material Volumes Studied by Multidisciplinary Approach". Applied Sciences (Switzerland), 16 (2), art. no. 1091. DOI: 10.3390/app16021091.
Vastola, S., Tortoli, M., Torricelli, S., Brazzoli, M., D'Andrea, M.M., Chiarot, E. (2026). "Unraveling the mouse model of Staphylococcus aureus bacteremia and sepsis: a systematic approach to better characterize host/pathogen interactions". Microbiology Spectrum, 14 (3), pp. 1-14. DOI: 10.1128/spectrum.02642-25.
Olimpieri, T., Poerio, N., Saliu, F., Lorè, N.I., Ciciriello, F., Ponsecchi, G., D'Andrea, M.M., Alghisi, F., Cirillo, D.M., Fraziano, M. (2025). "Phosphatidylinositol 5-Phosphate-Loaded Apoptotic Body-Like Liposomes for Mycobacterium abscessus Infection Management in Patients With Cystic Fibrosis". Journal of Infectious Diseases, 232 (1), pp. e43-e47. DOI: 10.1093/infdis/jiaf124.
Ravenscroft, N., Nonne, F., Belciug, G.F., Zaro, M., Molfetta, M., Di Benedetto, R., Alfini, R., Mfana, S., Bellich, B., D'Andrea, M.M., Carducci, M., Rossi, O., Giannelli, C., Cescutti, P., Micoli, F. (2025). "Structural elucidation and serological studies of emerging Klebsiella pneumoniae capsular polysaccharides K102 and K112". Carbohydrate Polymers, 370, art. no. 124385. DOI: 10.1016/j.carbpol.2025.124385.
Frasca, S., Alabiso, A., Rotini, A., Manfra, L., Vasquez, M.I., Christoforou, E., Winters, G., Kaminer, M., D'Andrea, M.M., Migliore, L. (2025). "A Helping Hand: Fungi, as Well as Bacteria, Support Ecophysiological Descriptors to Depict the Posidonia oceanica Conservation Status". Water (Switzerland), 17 (8), art. no. 1151. DOI: 10.3390/w17081151.
Di Pilato, V., Pollini, S., Miriagou, V., Rossolini, G.M., D'Andrea, M.M. (2024). "Carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae: the role of plasmids in emergence, dissemination, and evolution of a major clinical challenge". Expert Review of Anti-Infective Therapy, 22 (1-3), pp. 25-43. DOI: 10.1080/14787210.2024.2305854.
Alabiso, A., Frasca, S., Bartolini, M., Congestri, R., D'Andrea, M.M., Buratti, G., Costa, F., Meraviglia, M., Nebuloni, A., Migliore, L. (2024). "Home Sweet Home: Setting the Best Thriving Conditions for the Ad Hoc Engineered Microbial Consortium in the Zero Mile System". Sustainability (Switzerland), 16 (6), art. no. 2227. DOI: 10.3390/su16062227.
Frasca, S., Alabiso, A., D'Andrea, M.M., Cattaneo, R., Migliore, L. (2024). "Diversity and Composition of Posidonia oceanica-Associated Bacterial and Fungal Communities: Effect of Boat-Induced Mechanical Stress in the Villefranche-sur-Mer Bay (France)". Diversity, 16 (10), art. no. 604. DOI: 10.3390/d16100604.
Frasca, S., Alabiso, A., D'Andrea, M.M., Migliore, L. (2024). "Uncovering the Fungal Community Composition of Alive and Dead Posidonia oceanica Matte". Microbial Ecology, 87 (1), art. no. 170. DOI: 10.1007/s00248-025-02492-6.
Olimpieri, T., Poerio, N., Ponsecchi, G., Di Lallo, G., D'Andrea, M.M., Fraziano, M. (2024). "Phosphatidylserine liposomes induce a phagosome acidification-dependent and ROS-mediated intracellular killing of Mycobacterium abscessus in human macrophages". Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 14, art. no. 1443719. DOI: 10.3389/fcimb.2024.1443719.
Ponsecchi, G., Olimpieri, T., Poerio, N., Antonelli, A., Coppi, M., Di Lallo, G., Gentile, M., Paccagnini, E., Lupetti, P., Lubello, C., Rossolini, G.M., Fraziano, M., D'Andrea, M.M. (2024). "Characterization of four novel bacteriophages targeting multi-drug resistant Klebsiella pneumoniae strains of sequence type 147 and 307". Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 14, art. no. 1473668. DOI: 10.3389/fcimb.2024.1473668.
Alabiso, A., Frasca, S., Cantelmo, V., D'Andrea, M.M., Braglia, R., Scuderi, F., Costa, F., Savio, S., Congestri, R., Migliore, L. (2023). "A dirty job: dishwasher wastewater reuse and upcycle through an ad hoc engineered microbial consortium". npj Clean Water, 6 (1), art. no. 66. DOI: 10.1038/s41545-023-00280-8.
Piccirilli, A., Antonelli, A., D'Andrea, M.M., Cherubini, S., Perilli, M., Rossolini, G.M. (2022). "Molecular and Kinetic Characterization of MOX-9, a Plasmid-Mediated Enzyme Representative of a Novel Sublineage of MOX-Type Class C β-Lactamases". Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 66 (9). DOI: 10.1128/aac.00595-22.
Poerio, N., Caccamo, N.R., La Manna, M.P., Olimpieri, T., De Angelis, L.H., D'Andrea, M.M., Dieli, F., Fraziano, M. (2022). "Phosphatidylserine Liposomes Reduce Inflammatory Response, Mycobacterial Viability, and HIV Replication in Coinfected Human Macrophages". Journal of Infectious Diseases, 225 (9), pp. 1675-1679. DOI: 10.1093/infdis/jiab602.
Poerio, N., Riva, C., Olimpieri, T., Rossi, M., Lorè, N.I., de Santis, F., de Angelis, L.H., Ciciriello, F., D'Andrea, M.M., Lucidi, V., Cirillo, D.M., Fraziano, M. (2022). "Combined Host- and Pathogen-Directed Therapy for the Control of Mycobacterium abscessus Infection". Microbiology Spectrum, 10 (1), art. no. e02546-21. DOI: 10.1128/spectrum.02546-21.
De Santis, F., Lopez, A.B., Virtuoso, S., Poerio, N., Saccomandi, P., Olimpieri, T., Duca, L., Henrici De Angelis, L., Aquilano, K., D'Andrea, M.M., Aquaro, S., Borsetti, A., Ceccherini-Silberstein, F., Fraziano, M. (2022). "Phosphatidylcholine Liposomes Down-Modulate CD4 Expression Reducing HIV Entry in Human Type-1 Macrophages". Frontiers in Immunology, 13, art. no. 830788. DOI: 10.3389/fimmu.2022.830788.
Poerio, N., Olimpieri, T., Henrici De Angelis, L., De Santis, F., Thaller, M.C., D'Andrea, M.M., Fraziano, M. (2022). "Fighting MDR-Klebsiella pneumoniae Infections by a Combined Host- and Pathogen-Directed Therapeutic Approach". Frontiers in Immunology, 13, art. no. 835417. DOI: 10.3389/fimmu.2022.835417.
De Angelis, L.H., Ponsecchi, G., Fraziano, M., D'Andrea, M.M. (2022). "Application of Bacteriophages for Human Health: An Old Approach against Contemporary 'Bad Bugs'". Microorganisms, 10 (3), art. no. 485. DOI: 10.3390/microorganisms10030485.
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